(一)水利工程施工前管理
水利工程施工前管理是水利工程管理的重要形式和内容，水利工程施工前管理主要包括:(1)投标文件的编制和承包合同的签定;(2)工程成本的合理预测和签订合理周密的施工合同。
(二)水利工程施工中管理
一是认真做好图纸会审和确定适宜的质量成本目标。
在图纸会审时，对于结构复杂、施工难度高的项目，要从方便施工、有利于加快工程进度、确保质量和降低资源消耗且增加工程效益几方面考虑，并提出修改意见;
二是优化施工组织设计，及时办理进度结算。
施工方案的优化是工程成本有效管理的主要途径，编制时应在技术标的基础上，做好优化细化工作;
三是搞好签证工作和严格劳务费用审核。
承包商应主动将发生变化的工程项目和单价上报监理工程师和业主，及时办理签证手续，以便于工程项目成本调整，劳务费结算是项目成本管理的又一关键环节，在已签订的劳务合同基础上，严格审核劳务分包工程量及零工结账单，从一线施工、材料部门到核算部门层层把关，防止超结多结现象，减少项目不合理的开支;
四是加强材料成本管理。
首先要在保证质量的前提下，坚持从“廉”采购;
第二，必须根据施工程序及工程进度，周密安排分阶段的材料计划，用好用活流动资金，在确保作业连续性的同时降低存储成本;
第三，加强现场管理，合理堆放，减少搬运和损耗;第四，严格执行材料消耗定额，对周转材料及大宗材料，如模板、架杆、方木、水泥、钢材、砂石料等要限额领料;第五，对各种材料，坚持余料回收，废物利用。
(三)水利工程施工后管理
一是竣工验收资料的准备和加强竣工结算管理。
合同条款对工程竣验收有十分明确的界定，以完工交付验收截止期作为衡量工期履约与违约的基本原则。因此，要做好工程验收资料的收集、整理、汇总，以确保完工交付竣工资料的完整性、可靠性。在竣工结算阶段，项目部有关施工、材料部门必须积极配合预算部门，将有关资料汇总、递交至预算部门，预算部门将中标预算、目标成本、材料实耗量、人工费发生额进行分析、比较，查寻结算的漏项，以确保结算的正确性、完整性。同时，可根据已签证的施工工艺(方法)，争取合理的签证或变更项目价格，以弥补原有定额偏低的缺陷。
二是加强资料管理和加强应收账款的管理。
施工中保存好各种与合同有关的资料，如施工日记、来往文件、气象资料、会议纪要、备忘录、工程声像资料等;对于业主变更设计图纸、增减工作量的，在补充合同中争取获得补偿。工程竣工以后，要及时进行结算，以明确债权债务关系。项目部要落实专人与业主加强联系，力争尽快回收资金。对一些不能在短期内偿清债务的甲方，通过协商签订还款计划，明确还款时间，制定违约责任，以增强对债务单位的约束力。对一些收回资金可能性较小的应收账款，可采取卜利清收等办法，以减轻成本损失。
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