1.合同管理制度审计
内部审计师应检查组织是否设置专门的合同管理机构以及专职或兼职合同管理人员是否具备合同管理资格；检查组织是否建立了恰当的合同管理制度；检查合同管理机构是否建立健全应对重大设计变更、不可抗力、政策变动等的风险管理体系。
2、专项合同通用内容的审计
内部审计师应检查合同当事人的法人资质、合同内容是否符合相关法律和法规的要求；检查合同双方是否具有从资金、技术及管理等方面履行合同的能力；检查合同的内容是否与招标文件的要求相符合；检查合同条款是否全面、合理，有无遗漏关键性内容，有无不合理的限制性条件，法律手续是否完备；检查合同是否明确规定双方的权利和义务；检查合同是否存在由于损害国家、集体或第三章利益等导致合同无效的风险；检查合同是否有过错方承担缔约过失责任的规定；检查合同是否有按优先解释顺序执行合同的规定。
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